sábado 7 de noviembre de 2009

Adaptación en segmentación

Que interesantes son estos temas n_n!

"Unlike most clams, Unio and it's relatives live in swift-flowing streams. Streams create a problem for the dispersal of larvae: because the adults are sedentary, free-swimming larvae would always be carried downstream by the current. These clams, however, have adapted to this environment by affecting two chages in their development. The first alters embryonic cleavage. In the typical cleavage of molluscs, either all the macromeres are equal in size or the 2D blastomere is the largest cell at that embryonic stage. However, the division on Unio is such that the 2d blastomere gest the largest amount of cytoplasm. This cell divides to produce most of the larval structures, including a gland capable of producing a large shell.

The resulting larvae (called glochidia) resemble tiny bear traps; they have sensitive hairs that cause the valves of the shell to snap shut when they are touched by the gills or fins of the wandering fish. They attach themselves to the fish and "hitchhike" with it until they are ready to drop off and metamorphose into adult clams. In this manner, they can spread upstream."

Male dysfunction...again!

Resulta que los genomas parentales no son equivalentes en el embrión. Ni así pueden chicos (XD no se crean)!:

"A majority of a human tumor called a hydatidiform mole, which resembles placental tissue, have been shown to arise from a haploid sperm fertilizing an egg in which the female pronucleus is absent. After entering an egg, the sperm chromosomes duplicate themselves, thereby restoring the diploid chromosome numbrer. Thus, the entire genome is derived from the sperm. Here we see a situation in which the cells survive, divide, and have a normal chromosome number, but development is abnormal. Insted of forming an embryo, the egg becomes a mass of placenta-like cells. Normal development does not occur when the entire genome comes from the male parent."

Twins

De nuevo no tengo nada de tiempo X_X. Me han pasado muchas cosas difíciles, muchas otras buenas. Mi cabeza es un remolino.

Mientras tanto, exploro las páginas de Scott Gilbert (el autor del libro que casi pierdo!!) y están estupendas. Incluso tienen secciones de humor.. demasiaaaaado biológicas jaja. Los artículos que contiene Zygote son sumamente interesantes.

Uno que de entrada me llamó la atención es sobre como gemelos verdaderos presentan fenotipos diferentes (es decir, no se parecen):

"(...) recent data have suggested that each of a pair of one-egg twins can develop very differently from the other, and these findings of "discordant monozygotic twins" have raised concerns about the assumptions underlying those studies that presume each of a pair of identical twins will develop the same way. In fact, Hall (1996) hypothesizes that the mechanism underlying the separation of blastomeres (which leads to identical twinning) may be genetic changes that distinguish the cells from each other. In this scenario, "identical" twinning is caused by the non-identity of the early blastomeres.

There are several cases in which identical twins can have discordant phenotypes. The major routes involve aneuploidy, X-chromosome inactivation differences, imprinting, and circulatory differences."

Una de las formas más extrañas es la de la Fecundación del Cuerpo Polar O_o:

"Between the concepts of monozygous twins and dizygous twins is the idea of polar body twins. In such cases, one sperm is thought to fertilize the egg, while another sperm is thought to fertilize a polar body. Bieber and colleagues (1981) analysed an acardiac fetus of a normal co-twin. Such embryos without hearts are only found to exist in situations of twinning, where circulation from the normal twin keeps the abnormal twin alive. In this case, the abnormal, acardiac, twin was an XXX triploid, having three complete chromosome sets. Analysis of chromosomes and major histocompatability antigens showed that the acardiac twin was preoduced from the fertilization of a sperm with the diploid first meiotic division polar body."


Algunos datos sobre Gemelos pegados:

CONJOINED TWINS

* are identical twins who develop with a single placenta from a single fertilized ovum.
* are always the same sex and race.
* are more often female than male, at a ratio of 3:1.
* occur as often as once in every 40,000 births but only once in every 200,000 live births.
* are more likely to occur in India or Africa than in China or the United States.
* may be caused by any number of factors, being influenced by genetic and environmental conditions. It is presently thought that these factors are responsible for the failure of twins to separate after the 13th day after fertilization. Conjoined twins can be artificially generated in amphibians by constricting the embryo so that two embryos form, one on each side of the constriction.
* There are no documented cases of conjoined triplets or quadruplets.


No explica por qué es más probable en India y África! alguien sabe?

viernes 30 de octubre de 2009

Rod y Gab + biolocosas

Ando algo corta de tiempo así que al grano.

El concierto de Rodrigo y Gabriela del lunes pasado me gustó mucho! Hasta pensé en comprar su nuevo disco. Me divertí bastante. Tocaron sus covers clásicos de Orion de Metallica y Stairway to Heaven de Led Zeppelin! Y también algunos de sus exitos como Diablo Rojo. Interactuan bien padre con el público. Rodrigo tocó con una velita, decoraron todo como altar de día de Muertos. Gabriela es increíble o_O. Medio mundo salió del concierto tratando de mover la mano como ella, incluyéndome jaja.



Finalmente vi Bastardos sin gloria. Me la pasé bien. Creo que el actor del malo es muy bueno, me impresionó su habilidad con los idiomas.

Hoy fue el examen de licenciatura de la chica Juniperus. Me gustó mucho su trabajo. En teoría podría heredarlo pero me dio la impresión de que ya no había mucho que yo pudiera hacer, ella hizo muchísimo!!! Se ganó mi total admiración. Al mismo tiempo me motivó para seguir estudiando, mi sentimiento de pesada ignorancia se acentúo gacho.

Por último, acabo de leer sobre Saundersites illiosiensis, un cephalopodo del carbonífero con rastros del manto y de tinta!!! En realidad el fósil ya tiene rato y había sido descrito con el género Jeletzkya pero como que no sabían bien qué onda con él, no le habían encontrado estos rastros de manto que comento. Lo único malo es que no encuentro fotos!

En fin, debo seguir estudiando.

Mi perro tiene cáncer. Quiero ir a Oaxaca. Ando algo triste.

miércoles 14 de octubre de 2009

Selection

Ayer y Hoy hubo un par de seminarios en el Instituto de Ecología de la UNAM. Ambos tocaron temas extremadamente interesantes, que tienen mucha relación con la ecología evolutiva (justo lo que estoy viendo en Ecología de Poblaciones) y selección (Genética de Poblaciones y Taller), así que vino a aclararme muchas cosas y confundirme en muchas más.

La primera, de una chica bastante guapa, girly y gringa que muy adecuadamente trabajaba con Strawberry, fue muy muy buena. De las cosas babosas que me impresionaron fue que en sus agradecimientos incluía a 69 esclav.. digo, alumnos de licenciatua que le ayudaron (69!!!) y como 8 monos de doctorado. Claro, lo que nos expuso fue un mini resumen de 20 años de trabajo en los que exploró desde lo muy muy básico, como adecuación en diferentes morfos sexuales en la fresa hasta la mismísima evolución de cromosomas sexuales (super topic). Muy a grandes rasgos, la chica, Tía-Lynn Ashman (University of Pittsburgh), explica paso por paso y con metodologías ecológicas que me dejaron hipnotizada, como puede darse la evolución de hermafrodita a sexos separados (dioico). Nunca pensé que la fresa fuera tan interesante (la especie que usó, Fragaria virginiana por ejemplo, es octoploide pero se comporta como diploide @_@). Altamente recomendable, checaré sus trabajos en el futuro.

La segunda, fue de un aleman con una trayectoria académica muy impresionante y que trabaja en uno de los pocos lugares en los que me interesaría estudiar peces: el lago Tanganyika. Por supuesto usó uno de los cíclidos de la zona (nota: El lago Tanganyika es famoso por una explosión de biodiversidad en especies de peces cíclidos estúpida y fascinantemente grande). Ese pez sí que me gustó.

Resulta que Lamprologus callipterus puede tener tres tipos de machos (in a similar fashion of some lizard), uno grande, territorial, que despliega ante las hembras y que, he aquí lo simpático, pasa la mayor parte del tiempo buscando y acumulando conchas de caracoles donde más tarde sus hembras vivirán y pondrán huevos (el investigador, Michael Toborsky, University of Bern, los llamaba Bourgeois males). En contraste, existe un macho pequeñito, incluso más pequeño que la hembra, que se escabulle cuando el Bourgeois no lo vé, se mete en la concha y fertiliza los huevos que deja la hembra. El último tipo de macho es llamado el Sneaker que es mucho menos frecuente y puede variar en tamaños, desde muy chico hasta muy grande. Es el resultado de cualquiera de los genotipos anteriores que bajo x o y circunstancia, no se desarrollaron tan padre y recurrieron a ser todos "equis".

In the cichlid fish Lamprologus callipterus from Lake Tanganyika, females spawn in empty snail shells. Giant territorial males collect and defend these shells, although tiny males can enter a shell during spawning to fertilize the eggs from inside. Preliminary evidence from growth data suggests that these strategies are fixed (T. Sato and M. Taborsky, unpublished).

En fin, también ocupa unas técnicas de monitoreo de animales sólo posible con dinero de primer mundo, y calcula muchos datos super coquetos. Debo decir, no era el mejor expositor, pero su trabajo es en extremo interesante, porque es un ejemplo de "selección dependiente de frecuencia" y porque da explicaciones muy interesantes, incluyendo la eficacia de los espermatozoides de cada fenotipo de macho, sobre la evolución de alternative behavioral tactics.

Algo que me dejó pensando mucho, es que después de la conferencia, Daniel (asesor) dijo algo sobre el tema. De hecho, por eso puse selección dependiente de frecuencia entre comillas. Justamente, bajo lo que estamos viendo en Genética de poblaciones, el modelo de Guillespie sobre selección en ambientes heterogeneos, este tipo de fenómenos puede explicarse con pura selección direccional, es decir, en realidad.. no hay tal cosa como selección dependiente de frecuencia... @_@. No puedo afirmarlo del todo, aún no he leido lo suficiente al respecto.

martes 13 de octubre de 2009

I thought it was a joke at first

Lo lei, me reí... y luego... ardí en deseos por poseerlo!!!

Un
artículo que aparentemente no puedo bajar del Proceedings of the Royal Society!!

Sauropod dinosaurs evolved moderately sized genomes unrelated to body size

Chris L. Ogan, Sephen L. Brusatte & Koen Stein

Sauropodomorph dinosaurs include the largest land animals to have ever lived, some reaching up to 10 times the mass of an African elephant. Despite their status defining the upper range for body size in land animals, it remains unknown whether sauropodomorphs evolved larger-sized genomes than non-avian theropods, their sister taxon, or whether a relationship exists between genome size and body size in dinosaurs, two questions critical for understanding broad patterns of genome evolution in dinosaurs. Here we report inferences of genome size for 10 sauropodomorph taxa. The estimates are derived from a Bayesian phylogenetic generalized least squares approach that generates posterior distributions of regression models relating genome size to osteocyte lacunae volume in extant tetrapods. We estimate that the average genome size of sauropodomorphs was 2.02 pg (range of species means: 1.77–2.21 pg), a value in the upper range of extant birds (mean = 1.42 pg, range: 0.97–2.16 pg) and near the average for extant non-avian reptiles (mean = 2.24 pg, range: 1.05–5.44 pg). The results suggest that the variation in size and architecture of genomes in extinct dinosaurs was lower than the variation found in mammals. A substantial difference in genome size separates the two major clades within dinosaurs, Ornithischia (large genomes) and Saurischia (moderate to small genomes). We find no relationship between body size and estimated genome size in extinct dinosaurs, which suggests that neutral forces did not dominate the evolution of genome size in this group.



UUUUH????

Si alguien lo puede bajar, por fas, pásemelo.

viernes 9 de octubre de 2009

Sperm dysfunction

Me dejaron en Animales III leer un artículo sobre el espermatozoide (Barratt et al. 2009, The human sermatozoon- a stripped down but refined machine). Me llamaron la antención algunos datos:

1. Uno de cada 20 hombres tiene espermatozoides chafas.
2. Aproximadamente 80 millones de parejas en el mundo son subfértiles (es decir, que después de darle duro durante un año no obtienen resultados).
3. "There is no drug a man can take to improve sperm function". La única ayudadita que les pueden dar es poner el espermatozoide a lado del óvulo o, ya de plano, inyectárselo intracelularmente al óvulo. Para la primera opción, in vitro fertilization IVF, hay que poner de 500000 a 50000 espermatozoides por óvulo!! La segunda, ICSI, aplica cuando hay muy poquitos espermatozoides en la eyaculación (menos de 2-3 x 10^6) y cuando son débiles o anormales.
4. Las técnicas dichas cuestan al rededor de 7000 euros por ciclo en UK, son invasivas y para colmo tienen éxito limitado!
5. Un hombre produce cerca de 1000 espermatozoides every heartbeat!!
6. El espermatozoide tiene proteosoma 0_o
7. El daño en el DNA de los espermatozoides es común y puede que si aplican la inyectada ICSI, hagan óvulos fecundados chafas y los implanten así >_<, i.e, pagas 7000 euros para que te pongan algo que no se va a desarrollar chido. Si los hijos sí nacen y todo, se ha visto (en ratones, claro) que hay efectos en el comportamiento, alta incidencia de cáncer y envejecimiento prematuro!
8. "Sperm preferentially swim along surfaces and thus might crawl, rather than swim, up the female reproductive tract."

Ya viene mi práctica de espermatogénesis, quién se apunta??!, es la perfecta oportunidad para contarles que tan chafas están sus espermatozoides gratis!



Por último, a quien le interese la paleo, chequen el último artículo de PALAEOBLOG, o lo que es lo mismo, el artículo sobre Archaeopteryx, que aparentemente tenía crecimiento reptileano (más como los dinos, pues) y que aonda un poco en cosas interesentantes, como que ninguno de los ejemplares que existen de Archaeopteryx es adulto!